EZR（Easy R）の使い方｜導入から論文での引用・報告まで

EZR（Easy R）は、統計ソフトRをマウス操作で使えるようにした無料のソフトウェアです。自治医科大学附属さいたま医療センターの神田善伸氏が開発し、生存時間解析、ROC解析、メタアナリシス、サンプルサイズ計算など、臨床研究でよく使う解析がそろっています。使い方の流れは、インストール、CSVの読み込み、記述統計、検定、生存時間解析の順です。論文では、EZRとRのバージョンをMethodsに書き、Kanda（2013）を引用します。本記事はこの流れを実データで確かめ、Methodsの英文例と、EZRだけでは足りない場面の目安を示します。

先にお断りしておくことが2つあります。1つ目は、本記事の数値はRのコードをR 4.3.3で実行した結果であり、EZRの画面から出したものではないことです。EZRのメニュー操作はRのコマンドを作って実行する仕組みです（公式ページ）が、本記事ではEZRの画面を実行していないため、スクリーンショットは載せていません。2つ目は、メニュー名について、Kanda（2013）に印刷されている英語表記と、公式のFAQ・ダウンロードのページに載っている日本語表記だけを使っていることです。日本語のメニュー名を確認できなかった箇所には、日本語名を書いていません。

本記事が扱うのはソフトの使い方と論文での書き方です。どの検定を選ぶかは統計検定の選び方をご覧ください。

1. EZRとは何か、何ではないか

項目	公式情報の内容	出典
開発者	神田善伸氏（自治医科大学附属さいたま医療センター血液科）	PubMedの書誌情報、公式ページ
位置づけ	Rのグラフィカル・ユーザー・インターフェース。公式文例では「生物統計でよく使う統計機能を加えるよう設計した、Rコマンダーの改変版」と説明	公式ページ（推奨Methods文例）
追加された機能	生存時間解析（競合リスク解析と時間依存性共変量を含む）、ROC解析、メタアナリシス、サンプルサイズ計算などを、ポイント・アンド・クリックで実行	Kanda（2013）の抄録
費用とライセンス	無料。R、Rコマンダー、EZRはGNU General Public License（GPL）に従い、EZRは「完全に無保証」。CRANの表記はGPL-2またはGPL-3	公式ページ、CRAN
対応環境	Windows、Mac OS X、Linux向けの版がある。CRANにはパッケージ（RcmdrPlugin.EZR）としても登録	公式ページ、CRAN
バージョン	公式ページのインストーラーは1.68（2024年6月30日）。CRANのパッケージページは1.70（2025年12月8日公開、NEWSによれば修正ポアソン回帰を追加）。いずれも2026年10月7日に確認	公式ページ、CRAN
マニュアル	完全なマニュアルは日本語の書籍のみ。英語ではKanda（2013）が簡易マニュアルとして使える	公式の英語ページ、CRAN
サポート	開発者個人が対応。FAQには、問い合わせへの回答は個別に行い、返信できるとは限らないと記載	公式FAQ

EZRはR上で動くため、EZRで行う解析はRの解析です。ダイアログを操作するたびにRのコマンドが作られてスクリプトウィンドウに表示され、そのコマンドと出力は保存できます（Kanda 2013では「File」→「Save script as」、「File」→「Save output as」）。保存したスクリプトがあれば、共著者や統計の専門家が「何をしたか」を確認できます。これが、EZRを使う大きな利点です。

一方で、EZRは「自分の研究にどの解析が必要か」を決めてはくれません。ダイアログには、入力したとおりの解析を実行する機能しかありません。

2. EZRのインストール

公式のWindows向けページには、2つの方法が書かれています。

1. インストーラーを使う方法（開発者が推奨）。ダウンロードのページからEZRsetup（英語版はEZRsetupENG.exe）を入手して実行すると、EZRがRとRコマンダーと一緒にインストールされます。現在のインストーラーに含まれるのはR 4.3.1とRコマンダー2.9-1です（公式ページ、2026年10月7日確認）。開発者がこの方法を勧める理由は、EZRが依存するパッケージが更新されるとEZRで予期しないエラーが出ることがあるためです。
2. CRAN経由で入れる方法。Rをインストールし、Rのコンソールで install.packages("RcmdrPlugin.EZR", dependencies=TRUE) を実行して library(Rcmdr) を入力し、Rコマンダーのメニュー「ツール」→「Rcmdrプラグインのロード」からRcmdrPlugin.EZRを選びます。最新のRが使える一方、上で述べたエラーのリスクがあります。

インストール後は、デスクトップのショートカットからEZRを起動します。「R Console」と「EZR on R Commander」の2つのウィンドウが開きます。操作に使うのは後者で、前者はEZRがその上で動いているため閉じてはいけません（Kanda 2013）。既定のデータフォルダは、ショートカットのプロパティの「作業フォルダ」欄で変更できます。

公式FAQが注意を促している点は次のとおりです。

• 文字コード。R 4.2以降、Windows版のRはCP932（Shift-JIS）ではなくUTF-8を標準にしました。以前の日本語を含むファイルは、読み込めない、または文字化けすることがあります。Excelでは「CSV UTF-8」で保存するとUTF-8、単なる「CSV」で保存するとCP932になります。読み込みのダイアログでは、ファイルのエンコードに「CP932:旧Windows形式」を指定できます。
• Excelファイル。ファイル名や上位フォルダ名に全角文字が含まれると、読み込めないことがあります。その場合はExcelからCSV形式で保存して読み込みます。
• Mac。公式のMac向け手順では、EZRにはX11ウィンドウシステム（XQuartz）が必要とされています。FAQは、Macで起動しない原因のほとんどはEZRではなくRコマンダーのインストールにある、としています。

3. データの読み込み

1行に1人、1列に1変数の形で表を作り、CSV（UTF-8）で保存します。公式ページはCSVでの読み込みを推奨しており、日本語の変数名も扱えますが、英字の大文字と小文字は厳密に区別されると注意しています。

• 読み込み：Kanda（2013）の表記では「File」→「Import data」→「Read Text Data From File, Clipboard or URL」です。公式FAQの日本語表記は、「ファイル」→「データのインポート」→「ファイルまたはクリップボード、URLからテキストデータを読み込む」です。スプレッドシートからの貼り付けは、「Clipboard」を選び、区切りにタブを指定して行えます（Kanda 2013）。
• 読み込めたかの確認：「View」ボタンでデータを表示できます。「Active data set」→「Variables」→「Show variables in active data set」で変数の一覧が出ます（Kanda 2013）。
• 解析前の加工：「Active data set」→「Variables」には、数値変数の区分化、新しい変数の作成、ダミー変数の作成などがあります（Kanda 2013）。

生存時間データのコーディングに注意。EZRの生存時間解析のダイアログでは、時間の変数と、イベントありを1、なしを0とするステータス変数が必要です（Kanda 2013）。公開データセットにはコーディングが異なるものが多くあります。Rのsurvivalパッケージの lung は、打ち切りが1、死亡が2です（Rのヘルプ）。そのため、先に変換が必要です。次の確認は、解析の前に変換が正しいことを示しています。

d <- survival::lung
d$event <- ifelse(d$status == 2, 1, 0)   # 1 = 死亡, 0 = 打ち切り
table(d$status, d$event)

   
      0   1
  1  63   0
  2   0 165

4. 解析の流れ：実データで確かめる

データ。survival::lung は、North Central Cancer Treatment Group（NCCTG）の進行肺がん患者228人のデータです（Rのヘルプ。元の報告はLoprinziら, J Clin Oncol 1994［文献3］）。使う変数は、time（生存期間、日）、status、age、sex（1 = 男性、2 = 女性）、ph.ecog（医師が評価したECOGパフォーマンスステータス）です。ECOGの値がない患者が1人います。この例は解析の流れを示すために選んだもので、臨床的な知見ではありません。

実行したもの。以下のRコマンドは、各ステップで挙げるEZRのメニュー項目に相当する、素のRのコマンドです。EZRが実際に生成するスクリプトそのものではなく、出力もEZRの画面ではなく、R 4.3.3とsurvival 3.8.6によるものです。

ステップ1：記述統計

EZRのメニュー（Kanda 2013）：カテゴリ変数は「Statistical analysis」→「Discrete variables」→「Frequency distributions」、連続変数は「Statistical analysis」→「Continuous variables」→「Numerical summaries」（平均、標準偏差、最小値、中央値、最大値）です。公式の変更履歴には、論文の表1に当たる背景データのサマリー表を、バージョン1.23からtableoneパッケージを使って自動作成する機能が加わったと書かれています。

d$sex <- factor(d$sex, 1:2, c("Male", "Female"))
nrow(d); table(d$sex)
c(mean = mean(d$age), sd = sd(d$age))
aggregate(age ~ sex, d, function(x) round(c(n = length(x), mean = mean(x), sd = sd(x)), 2))

実際の出力：228人（男性138人、女性90人。男性は60.5%）。年齢は平均62.45歳、標準偏差9.07（範囲39〜82歳）。男性はn = 138、平均63.34、標準偏差9.14。女性はn = 90、平均61.08、標準偏差8.85。ECOGスコアが0、1、2、3、欠測の人数は、順に63、113、50、1、1です。

ステップ2：2群の比較

EZRのメニュー（Kanda 2013）：t検定は「Statistical analysis」→「Continuous variables」、Mann-WhitneyのU検定は「Statistical analysis」→「Nonparametric tests」です。割合の比較は「Statistical analysis」→「Discrete variables」→「Create two-way table and compare two proportions」で、既定の検定はFisherの正確確率検定です（Kanda 2013）。どの検定を使うかは、P値を見る前に解析計画で決めておきます。詳しくは統計検定の選び方とカイ二乗検定とFisher正確検定をご覧ください。

t.test(age ~ sex, data = d)                       # Welch（Rの既定）
wilcox.test(age ~ sex, data = d, exact = FALSE)
d$ecog <- factor(ifelse(d$ph.ecog >= 1, "ECOG>=1", "ECOG 0"), c("ECOG 0", "ECOG>=1"))
tab <- table(d$sex, d$ecog); tab
fisher.test(tab)

実際の出力：

• 年齢、男性と女性の比較：Welchのt = 1.8632、自由度194.72、P = 0.06394。平均値の差は2.26歳（95%信頼区間 −0.13〜4.66）。等分散を仮定するt検定ではt = 1.8504、自由度226、P = 0.06556、Mann-WhitneyのU検定ではW = 7136.5、P = 0.05701でした。この例では3つとも同じ方向ですが、2種類のt検定は別のオプションなので、ダイアログでどちらを選んだかを報告する必要があります。
• ECOGスコア1以上：男性は137人中101人（73.7%）、女性は90人中63人（70.0%）。Fisherの正確確率検定はP = 0.5482、オッズ比0.83（95%信頼区間 0.44〜1.57）でした。

ステップ3：生存時間解析

EZRのメニュー（Kanda 2013）：「Statistical analysis」→「Survival analysis」→「Kaplan-Meier survival curve and logrank test」と、同じ「Survival analysis」の中の「Cox proportional hazard regression」です。後者のダイアログには、3水準以上の因子の全体のP値のためのWald検定、比例ハザード性の確認、変数増減法といったオプションがあります。時間の変数、次にステータス変数（1 = イベント）を指定します。

library(survival)
fit <- survfit(Surv(time, event) ~ sex, data = d)
fit
survdiff(Surv(time, event) ~ sex, data = d)
cx <- coxph(Surv(time, event) ~ sex + age, data = d)
summary(cx)
cox.zph(cx)

実際の出力：

• 228人中165人が死亡しました（男性112人、女性53人）。
• 生存期間の中央値：男性270日（95%信頼区間 212〜310）、女性426日（95%信頼区間 348〜550）。全体の中央値は310日（95%信頼区間 285〜363）。逆Kaplan-Meier法による追跡期間の中央値は588日（95%信頼区間 511〜1010）でした。
• 365日時点の生存率：男性33.6%（95%信頼区間 26.1〜43.3）、女性52.6%（95%信頼区間 42.1〜65.8）。
• ログランク検定：カイ二乗値10.3、自由度1、P = 0.0013。
• 性別と年齢を入れたCox回帰（n = 228、イベント165）：男性に対する女性のハザード比0.60（95%信頼区間 0.43〜0.83）、P = 0.0022。年齢のハザード比は1歳あたり1.017（95%信頼区間 0.999〜1.036）、P = 0.065。比例ハザード性の確認（cox.zph）は、全体でP = 0.25（性別0.11、年齢0.65）でした。

図の読み方：このデータでは女性のほうが生存期間が長く（ログランク検定 P = 0.0013、調整後のハザード比0.60）、数値はすべて、EZRのダイアログが呼び出すRの標準関数から得られています。論文で大切なのは、どのオプションを選んだかを書くことです。Kaplan-Meier曲線とCoxモデルの読み方と報告の詳細は、別の記事で扱います。

5. 論文への書き方：Methods、引用、バージョン

開発者が求めていること

公式ページは、EZRを使った論文では、Kanda Y., Bone Marrow Transplantation 2013; 48: 452-458 を引用するよう求め、統計解析の記載の例として次の文を挙げています。

All statistical analyses were performed with EZR (Jichi Medical University, Tochigi, Japan), which is a graphical user interface for R (The R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria). More precisely, it is a modified version of R commander designed to add statistical functions frequently used in biostatistics.

ICMJE勧告は、統計ソフトウェアのパッケージとバージョンを明記するよう求めています（「Preparing for submission」のMethods）。SAMPLガイドラインも、使用した統計パッケージまたはプログラムの名称を書くよう求めています（Lang と Altman, 2015）。公式の文例にはバージョン番号がないため、書き加えてください。

Methodsの文例（ご自身の解析に合わせて調整してください）

Statistical analyses were performed with EZR (version X.XX; Jichi Medical University, Tochigi, Japan), a graphical user interface for R (The R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria; version X.X.X), which is a modified version of R commander designed to add statistical functions frequently used in biostatistics (Kanda, 2013). Continuous variables were compared with the Mann-Whitney U test and categorical variables with Fisher’s exact test. Overall survival was estimated by the Kaplan-Meier method and compared with the log-rank test. Hazard ratios were estimated by Cox proportional hazards regression, and the proportional-hazards assumption was checked with Schoenfeld residuals. Two-sided P values below 0.05 were considered statistically significant.

検定の名前は、事前に計画して実際に行ったものに置き換えてください。1文目は開発者の文例を基にバージョンと引用を加えたもので、2文目以降は当社の文例であり、公式の文章ではありません。「Schoenfeld残差で確認した」は、実際にそれを行った場合だけ書いてください。Kanda（2013）はCoxのダイアログに比例ハザード性の確認のオプションがあると述べ、公式の変更履歴にはバージョン1.33で変数ごとのSchoenfeld残差プロットが加わったとあります。

バージョン番号の調べ方

スクリプトウィンドウに R.version.string と入力して実行します。パッケージがそのRのライブラリに入っていれば、packageVersion("RcmdrPlugin.EZR") も使えます（スクリプトウィンドウにはRのコマンドを入力できます。Kanda 2013）。インストーラーの各版がGUI上で自分のバージョンをどう表示するかは、本記事では確認していません。使ったインストーラーのダウンロードページにもバージョンが書かれています（確認時点では1.68）。CRANのパッケージは別系統のリリース（1.70）です。実際に使ったバージョンを書いてください。

引用の書き方

• EZR：Kanda Y. Investigation of the freely available easy-to-use software ‘EZR’ for medical statistics. Bone Marrow Transplant. 2013;48(3):452-458. doi:10.1038/bmt.2012.244. PMID 23208313.
• R（ジャーナルが別途の記載を求める場合）：Rの citation() コマンドが推奨の引用を表示します。R 4.3.3では次のように出力されます。R Core Team (2024). R: A Language and Environment for Statistical Computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. https://www.R-project.org/ 。年はリリースにより変わるため、お使いのバージョンでコマンドを実行してください。

Resultsの書き方（実際の数値を使った例）

Women had longer overall survival than men (median 426 days, 95% CI 348 to 550, versus 270 days, 95% CI 212 to 310; log-rank P = 0.0013). In a Cox model including age, the hazard ratio for women versus men was 0.60 (95% CI 0.43 to 0.83; P = 0.0022).

群ごとの人数とイベント数（男性138人でイベント112件、女性90人でイベント53件）を、同じ段落か表に示します。効果はP値だけでなく信頼区間とともに報告します。報告全般は論文における統計解析結果の報告方法をご覧ください。

6. EZRの限界と、統計の専門家に相談する目安

資料から言える限界

• ダイアログが行うのは計算で、判断ではありません。既定値（たとえば2×2表のFisherの正確確率検定）はありますが、既定値も1つの選択です。選んだオプションを報告してください。
• 多数の解析を簡単に実行できます。計画がないと、選択的な報告につながります。多重比較補正と統計エラー10選をご覧ください。
• RとRコマンダーのバージョンに依存します。パッケージの更新でEZRが壊れることがあるため、開発者はオールインワンのインストーラーを勧めています。R 4.2での文字コード変更も、すでにファイルの読み込みの問題を起こしました。
• ダイアログの守備範囲。Kanda（2013）は、2013年版の時間依存性共変量の機能が、0から1へ1回だけ変わる単純な共変量に限られると述べています。公式ページによればバージョン1.52以降は複数を扱えます。決めつけずに、現在のダイアログで何ができるかを確認してください。
• 資料とサポート。完全なマニュアルは日本語のみで、サポートはボランティアの医師1人が担っています。
• 保証。Rと同様、「完全に無保証」です。
• メニューにない解析。スクリプトウィンドウにRのコードを入力して実行できますが、その場合はRのプログラミングを行うことになります。

専門家に相談する目安

以下は公式の規則ではなく、当社の実務上の見方です。

• 調整に使う共変量の選び方、傾向スコアや重み付けのデザイン、競合リスクのモデルを決める必要がある。EZRはこれらを実行できますが、何が適切かは研究デザインの問題です。
• 査読者から、メニューに見当たらない解析や、事前に計画した検定とは別の検定を求められた。
• 欠測、クラスタリング、反復測定のあるデータで、ダイアログがどう扱うか分からない。
• 投稿前に、保存したスクリプトから第三者に結果を再現してもらいたい。

このような統計支援は、ICMJEの著者資格の基準に照らしても正当な貢献です。研究の問い、解釈、結論は引き続き著者のものです。

7. Methodsを書く前のチェックリスト

1. EZRのバージョンとRのバージョンを、実際に使ったソフトから書き写した。
2. Kanda（2013）を引用した。ジャーナルが求める場合はRも引用した。
3. 使ったすべての検定を、選んだオプション（Welchか等分散を仮定するt検定か、両側かなど）とともに書いた。
4. 生存時間データ：時間の単位、イベントの定義、打ち切りの扱い、ステータスを1 = イベント・0 = 打ち切りとしたことを書いた。
5. EZRで保存したスクリプトを、データと一緒に保管した。
6. 効果量は95%信頼区間とともに、P値は正確な値で報告した。
7. 事前に計画していない解析には、探索的であることを明記した。

当社がお手伝いできること

まとめ

• EZRは、神田善伸氏（自治医科大学）が開発した、Rベースの無料のポイント・アンド・クリック型ソフトです。メニュー操作はRのコマンドを作り、保存して共有できます。
• 公式のインストーラー（確認時点でR 4.3.1とRコマンダー2.9-1を同梱）かCRAN経由で入れます。日本語のCSVを読み込むときは、UTF-8への変更に注意してください。
• 基本の流れは、CSVの読み込み、変数とコーディングの確認（ステータスは1 = イベント）、記述統計、検定、Kaplan-MeierとログランクのP、Cox回帰です。
• 実データの例（survival::lung、n = 228）では、ログランク検定のPは0.0013、女性の調整後ハザード比は0.60（0.43〜0.83）でした。これらの数値はRによるもので、EZRの画面から得たものではありません。
• 論文では、Kanda（2013）を引用し、EZRとRをバージョン付きで書き（ICMJEはバージョンの記載を求めています）、選んだオプションを報告します。
• 調整の組み方、競合リスク、傾向スコアなどのデザイン上の判断は、ダイアログの設定ではなく統計上の問いとして扱ってください。

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• 生存時間分析の書き方（カプランマイヤー・ログランク・Cox）
• ノンパラメトリック検定の選び方（Mann-Whitney・Kruskal-Wallis・Wilcoxon）

よくある質問

Q. EZRは無料で使えますか？
はい。公式ページによると、R・Rコマンダー・EZRはGNU General Public License（GPL）に従っており、EZRは完全に無保証です。CRANのパッケージページでもライセンスはGPL-2またはGPL-3と記載されています。

Q. EZRを論文で引用するにはどうしますか？
公式ページは、Kanda Y. Bone Marrow Transplantation 2013; 48: 452-458（doi:10.1038/bmt.2012.244）の引用を求めており、EZRとRを記載する文例も示しています。ICMJE勧告がソフトウェアのバージョンの記載を求めているため、EZRとRのバージョン番号も書き添えてください。

Q. EZRとRの結果は同じになりますか？
EZRはR上で動き、メニュー操作はRのコマンドを作って実行します（公式ページ）。そのため、同じ関数を同じオプションで使えば結果は一致するはずです。ただし本記事ではEZRの画面は実行しておらず、並べて比較はしていません。本記事の数値はRの出力です。

Q. バージョンは1.68と1.70のどちらを書けばよいですか？
実際に使ったバージョンを書いてください。2026年10月7日の確認時点で、公式ページのインストーラーは1.68（2024年6月30日）、CRANのパッケージページは1.70（2025年12月8日公開）と記載されていました。

Q. 日本語のCSVを読み込むと文字化けします。どうすればよいですか？
公式FAQによると、R 4.2以降のWindows版RはUTF-8を標準にしています。Excelでは「CSV UTF-8」で保存するか、古いCSVの場合は読み込みダイアログでファイルのエンコードに「CP932:旧Windows形式」を指定してください。

参考資料

PubMed収載の文献（各文献は2026年10月7日にNCBI E-utilitiesのesummaryで確認）

1. Kanda Y. Investigation of the freely available easy-to-use software ‘EZR’ for medical statistics. Bone Marrow Transplant. 2013 Mar;48(3):452-458. doi: 10.1038/bmt.2012.244. PMID: 23208313. PMCID: PMC3590441（全文を確認）。
2. Lang TA, Altman DG. Basic statistical reporting for articles published in biomedical journals: the “Statistical Analyses and Methods in the Published Literature” or the SAMPL Guidelines. Int J Nurs Stud. 2015 Jan;52(1):5-9. doi: 10.1016/j.ijnurstu.2014.09.006. PMID: 25441757.（SAMPLの本文はEQUATOR NetworkのPDFで確認）。
3. Loprinzi CL, Laurie JA, Wieand HS, et al. Prospective evaluation of prognostic variables from patient-completed questionnaires. North Central Cancer Treatment Group. J Clin Oncol. 1994 Mar;12(3):601-607. doi: 10.1200/JCO.1994.12.3.601. PMID: 8120560.（Rのヘルプが示すlungデータの出典として挙げたもので、この論文自体は読んでいません）。

組織・ソフトウェアの資料

• 神田善伸. フリー統計ソフトEZR（Easy R）. 自治医科大学附属さいたま医療センター血液科（2026年10月7日閲覧）：公式ページ、ダウンロード、EZRの使い方・変更履歴、FAQ、英語ページ
• CRAN. RcmdrPlugin.EZR（バージョン1.70、2025年12月8日公開）：パッケージページ、NEWS
• ICMJE. Recommendations（Preparing for submission、Methods、Statistics）
• EQUATOR Network. SAMPL Guidelines
• R Core Team. R: A Language and Environment for Statistical Computing。survivalパッケージ3.8.6の lung のヘルプ（本記事の作成に使ったR環境で確認）